细胞免疫功如T细胞、淋巴因子激活细胞(LAK)、自然杀伤细胞(NK)等，它们的活性和肿瘤周围淋巴细胞浸润的程度是人体抗肿瘤的防御屏障。免疫功能正常，则预后较好。癌前期细胞的恶化转化所产生的转肽酶(γ-GT)和碱性磷酸酶(ALP)明显升高者，术后复发率高。胎甲球(AFP)1000微克/升者，1年存活率为100%；AFP<5000微克/升者，1年存活率为75%；AFP>5000微克/升，1年存活率为51.3%。

　　据国内综合不同地区的统计资料，肝细胞癌病人中有70%-80%合并肝炎后肝硬化，另有10%-30%肝癌病人仅伴慢活肝。因此，肝功能状态对治疗及预后很重要。在224例病人调查中发现：血清胆红素>17.1微摩尔/升者，2年存活率为5%；胆红素>34.2微摩尔/升者，无一例生存1年。伴失代偿期肝硬化时，肝癌早期即可能死于肝功能衰竭。因此，发现肝癌时原有肝病越重，治疗效果越差，病死率越高。

　　一般认为，癌肿小者，生存率高。癌的面积>10厘米，1年生存率为37.5%；癌的面积<10厘米，1年生存率为63.2%。癌的分化程度低者，恶性程度高，容易发生转移现象，导致短期内死亡。单一小肝癌较多发癌结节者5年存活率高10倍。生长速度快，门静脉内已有癌栓形成者，5年存活率为4.8%，无癌栓形成者存活率为50%。肿瘤生长不规则，外无包膜者均提示预后不良，即使手术效果也不会很好。病理上肿瘤为透明细胞癌、纤维板层型癌生长较慢，癌包膜完整，或癌纤维组织量多，在一定程度上限制了癌转移和扩散的，预后好。